Дія бере початок у листопаді 2010 року і розгортається у поле атрактора β.Рінтаро Окабе впав у відчай і щосили намагається оговтатися від останньої невдалої спроби змінити майбутнє. Прагнучи забути все те, що він пережив у минулому, і позбутися від хворобливих спогадів, він вирішує закинути своє друге "я" в особі божевільного вченого і почати жити як і слід звичайному студенту. Щойно, здавалося б, життя починає налагоджуватися, він раптово зустрічає Хіяджьо Махо, знайому Макісе Кріс з американського університету. Махо розповідає Рінтаро, що в їхній лабораторії вже почали тестування нового винаходу, який надає можливість зберігати пам'ять людини і здатний відтворити усі його характерні риси всередині себе. Можливість симулювати за допомогою цього пристрою пам'ять Кріс приносить у життя Окабе новий рейвах, немов повертаючи його до страшного минулого. Він навіть подумати не міг, що це принесе стільки мук і нових несподіваних наслідків..

Головний герой, навісний божевільний вчений, створює машину часу. Але не все так просто у нашому світі. СЕРН намагається перешкодити в оприлюдненні цієї інформації, оскільки володіє ексклюзивними правами на цей винахід. Починається полювання, і наш герой втрачає подругу. Аби повернути її, він мусить змінити плин часу і переписати історію.