Спеціального агента загону «Місія: Нездійсненна» Ітана Ганта та його колег несправедливо звинувачують у причетності до вибуху Кремля. Президент ініціює «Протокол Фантом», в результаті якого формально ліквідують спецпідрозділ, а Ітан залишається без будь-якої підтримки. Він має намір повернути своє добре ім'я і запобігти новій атаці, але робити це йому доведеться разом з командою колег, істинних мотивів яких він до кінця не знає.