En el año 2071, la humanidad ha colonizado varios de los planetas y lunas del sistema solar dejando atrás la superficie ahora inhabitable del planeta Tierra. La Policía del Sistema Inter Solar intenta mantener la paz en la galaxia, ayudado en parte por los cazadores de recompensas prohibidos, conocidos como "Cowboys". El equipo ragtag a bordo de la nave espacial Bebop son dos de esos individuos. Más suave y despreocupado Spike Spiegel es equilibrado por su bullicioso y pragmático compañero Jet Black mientras la pareja se gana la vida persiguiendo recompensas y recogiendo recompensas.